為配合政府產業政策發展，推動亞太營運中心(含南部科學園區、高雄多功能經貿園區與國際倉儲加工轉運中心等)，協助企業轉型升級，以及培育技術和管理人才，於2000年2月1日成立國立高雄大學，成為千禧年唯一新成立的國立大學。

本校自2000年設校之初，從僅有西洋語文學系、法律學系、政治法律學系、應用經濟學系、應用數學系、電機工程學系等6個大學部學系，一直持續成長至今擁有21個大學部、22個碩士班及3個博士班，未來將繼續朝向設立新穎、符合時代潮流的系所努力。